Правильный вариант написания – «мучительно-долгое ожидание». Слово «мучительно-долгое» – это сложное прилагательное. По правилам русского языка прилагательные пишутся через дефис, если образованы от равноправных слов, между которыми можно поставить союз «и». Пример: мучительное и долгое ожидание.