Правильный вариант написания – раздельный, «не числится». Слово «не» – это отрицательная частица, а слово «числится» – глагол в форме третьего лица единственного числа настоящего времени. По правилам русского языка отрицательные частицы с глаголами пишутся раздельно. Пример: Данный человек не числится в списках сотрудников нашей компании.